La medicina independiente es una de las profesiones con mayor potencial de ingresos en México — y también una de las que más confusión genera en materia fiscal. Muchos médicos operan sin facturar, sin declarar o en el régimen equivocado, acumulando riesgos con el SAT que pueden salir muy caros.

¿Qué Tipo de Contribuyente es un Médico Independiente?

Un médico que ejerce de forma independiente (no bajo relación laboral) es una persona física con actividad profesional. Sus ingresos son honorarios profesionales, no salario. Esto aplica si:

  • Tienes tu propio consultorio (en casa, renta o dentro de un hospital)
  • Atiendes pacientes a título personal y cobras directamente
  • Eres médico de guardia contratado por honorarios (sin relación laboral)
  • Tienes contrato de honorarios con una clínica u hospital privado

Si trabajas exclusivamente como empleado de un hospital o clínica con contrato laboral, eres asalariado y tu patrón retiene tu ISR — en ese caso este artículo aplica solo a los ingresos adicionales que tengas.

Régimen Fiscal Recomendado para Médicos

RESICO — Régimen Simplificado de Confianza

Para médicos con ingresos anuales menores a $3.5 millones, el RESICO es generalmente la mejor opción:

  • ISR del 1% al 2.5% sobre ingresos cobrados (sin deducir gastos)
  • Declaraciones mensuales muy sencillas
  • No se lleva contabilidad formal compleja

Un médico general que cobra $80,000 mensuales ($960,000 anuales) pagaría aproximadamente $19,200 de ISR anual en RESICO (2%) — una carga fiscal muy manejable.

Régimen General de Actividad Empresarial y Profesional

Conviene cuando:

  • Tus ingresos superan $3.5 millones anuales
  • Tienes gastos muy altos (renta de consultorio costoso, equipo médico nuevo, personal)
  • Quieres deducir inversiones significativas

En este régimen pagas ISR sobre la utilidad (ingresos − gastos), con tasas hasta el 35%.

¿Los Servicios Médicos Pagan IVA?

Aquí está la buena noticia: los servicios médicos están exentos de IVA según el Artículo 15, fracción XIV de la Ley del IVA, siempre que:

  • Los preste un médico titulado (con cédula profesional)
  • Sean servicios de medicina, odontología, hospitalización, cirugía u otras actividades directamente relacionadas con la salud

Esto significa que no cobras IVA a tus pacientes por las consultas médicas. Sin embargo, sí pagas IVA en tus gastos (equipo, renta, materiales) y ese IVA que pagas no es acreditable porque tus ingresos están exentos.

Excepción: Servicios No Médicos

Si además vendes medicamentos, suplementos, aparatos ortopédicos u otros productos en tu consultorio, esas ventas pueden causar IVA (al 0% para medicamentos, al 16% para otros productos).

Cómo Facturar Honorarios Médicos

Datos del CFDI

  • Clave de producto SAT: 85101500 — Servicios de medicina general, o la específica según tu especialidad
  • Unidad de medida: E48 (Unidad de servicio)
  • Concepto: "Honorarios médicos — consulta médica", "Honorarios médicos — cirugía", etc.
  • Objeto de impuesto: 01 — No objeto de impuesto (para servicios exentos de IVA)

¿Qué Pasa con las Retenciones de ISR?

Si tu cliente es una persona moral (hospital, clínica, empresa), te retendrá el 10% de ISR al pagarte. Esta retención es un crédito que descuentas de tu pago provisional mensual.

Si tu cliente es una persona física (el paciente directamente), no hay retención.

Gastos Deducibles para Médicos (Régimen General)

Consultorio y equipamiento:

  • Renta del consultorio (con CFDI del arrendador)
  • Equipo médico: estetoscopio, tensiómetro, electrocardiograma, ultrasonido (deprecian según vida útil)
  • Mobiliario del consultorio
  • Equipo de cómputo para expedientes electrónicos

Consumibles médicos:

  • Guantes, jeringas, gasas, vendas y material de curación
  • Medicamentos que administras en el consultorio

Personal:

  • Asistente o recepcionista (con IMSS y CFDI de nómina)
  • Enfermera de consultorio

Educación y actualización:

  • Cursos de educación médica continua (CME)
  • Membresías a colegios médicos y asociaciones
  • Suscripciones a revistas científicas y bases de datos médicas
  • Congresos y simposios

Seguros:

  • Seguro de responsabilidad civil médica (100% deducible)
  • Seguro de gastos médicos mayores propio (deducción personal)

Tecnología:

  • Software de expediente clínico electrónico (SICOR, Health Connect, etc.)
  • Plataformas de telemedicina

Médicos que Trabajan en Varios Lugares

Es muy común que un médico tenga ingresos de múltiples fuentes:

  • Consultorio propio
  • Guardia en hospital privado (honorarios)
  • Empleo en hospital público (IMSS, ISSSTE) — como asalariado

Para efectos fiscales, cada fuente de ingreso tiene su tratamiento. Los ingresos por honorarios se acumulan en tu declaración anual junto con los ingresos por salario. El SAT cruza toda esta información a través de los CFDI.

Telemedicina: ¿Cambia Algo Fiscalmente?

Si atiendes pacientes por videollamada (Zoom, Teams, plataforma propia), el tratamiento fiscal es el mismo: son honorarios por servicios médicos, exentos de IVA y acumulables para ISR. La diferencia es que puedes tener pacientes en otras ciudades o incluso en el extranjero.

Pacientes en el extranjero: los honorarios cobrados a pacientes fuera de México pueden considerarse exportación de servicios, con IVA al 0%.

Errores Fiscales Frecuentes en Médicos

  • No facturar las consultas argumentando que los pacientes no piden factura — el SAT cruza los depósitos bancarios con las declaraciones
  • No darse de alta en el SAT por creer que el hospital "ya los registra" — el contrato de honorarios no te exime de inscribirte
  • Confundir exención de IVA con exención de ISR — el ISR sí aplica a los honorarios médicos
  • No llevar registro de gastos del consultorio, perdiendo deducciones valiosas
⚠️ Aviso legal: La información de este artículo tiene carácter exclusivamente informativo y divulgativo. No constituye asesoría fiscal, contable ni legal. Las disposiciones tributarias pueden cambiar; consulta siempre con un profesional antes de tomar decisiones. ¿Necesitas orientación personalizada? Contáctanos aquí.